房产证上辅房和地下室区别是性质不同。辅房是指商业辅助用房的配套房，辅助商业房的开发使用。辅房是指各类商店、门市部、饮食店、粮油店、菜场、理发店、照相馆、浴室、旅社、招待所等从事商业和为居民生活服务所用的房屋，以及办公用房，如写字楼等，还包括车库等。根据工商行政管理局要求，公司的注册地址必须在商业辅助用房中，而不能注册在住宅中。地下室是指房间地面低于室外地平面的高度超过该房间净高的二分之一。多层和高层建筑物需要较深的基础，为利用这一高度，在建筑物底层下建造地下室，既可增加使用面积，又可省去房心回填土，还算比较经济。